報(bào)告題目:人工智能超級(jí)計(jì)算精準(zhǔn)藥物設(shè)計(jì)及新冠藥物研發(fā)應(yīng)用
報(bào)告時(shí)間:2022年8月14日(周日)下午4:00
報(bào)告地點(diǎn):綜合樓102會(huì)議室
報(bào) 告 人:魏冬青 教授
報(bào)告人單位:上海交通大學(xué)
報(bào)告人簡(jiǎn)介:
魏冬青,男,長(zhǎng)聘教授,博士生導(dǎo)師,上海交通大學(xué)生命學(xué)院及微生物代謝國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,Nature-Springer期刊“Interdisciplinary Sciences-Computational Life Sciences”主編(科學(xué)院2區(qū)), 高被引學(xué)者。長(zhǎng)期從事生物信息學(xué),生物體系的分子模擬,藥物代謝與個(gè)性化藥物, 疾病與生物標(biāo)志的精準(zhǔn)模型,計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì),蛋白質(zhì)相互作用與識(shí)別, 蛋白機(jī)器等領(lǐng)域的研究工作。主持國(guó)家重點(diǎn)研究領(lǐng)域項(xiàng)目,自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目和多項(xiàng)國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目。發(fā)表SCI文章600篇,主編專(zhuān)著9部,引用超過(guò)1.2萬(wàn)次,H因子62。中國(guó)交叉科學(xué)學(xué)會(huì)副理事長(zhǎng),中國(guó)衛(wèi)生信息學(xué)會(huì)大數(shù)據(jù)應(yīng)用評(píng)估與保障專(zhuān)業(yè)委員會(huì)副主委,中國(guó)運(yùn)籌學(xué)會(huì)計(jì)算系統(tǒng)生物學(xué)常務(wù)理事。獲得橫山亮次獎(jiǎng)、中華醫(yī)學(xué)二等獎(jiǎng)、計(jì)算機(jī)協(xié)會(huì)自然科學(xué)二等獎(jiǎng),上海市科學(xué)技術(shù)一等獎(jiǎng)和上海市優(yōu)博導(dǎo)師稱(chēng)號(hào)。
報(bào)告摘要:
我們開(kāi)發(fā)了多種分子模擬與AI藥物設(shè)計(jì)軟件,構(gòu)建中藥有效成分,細(xì)胞色素P450酶多態(tài)性基因型-表型相關(guān)性等數(shù)據(jù)庫(kù)。把圖學(xué)習(xí)、深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、 深度隨機(jī)森林、貝葉斯等 方法開(kāi)發(fā)了統(tǒng)計(jì)預(yù)測(cè)模型以及基于web的軟件工具并應(yīng)用到小分子藥物與多靶標(biāo)以及蛋白機(jī)器的關(guān)聯(lián),藥物構(gòu)效關(guān)系,藥物代謝以及毒理和基因表型相關(guān)性的研究中。 開(kāi)發(fā)了多靶標(biāo)藥物篩選、SNPs及ADMET 在線(xiàn)預(yù)測(cè)平臺(tái), 并將其應(yīng)用到各種典型體系,對(duì)個(gè)性化藥物用藥有一定的指導(dǎo)意義。通過(guò)超大規(guī)模的高性能計(jì)算和虛擬篩選,我們發(fā)現(xiàn)花椒有效成分WGX-50有可能作為治療阿爾茲海默癥的候選藥物,通過(guò)大量的實(shí)驗(yàn)證實(shí)了WGX-50在治療老年癡呆和皮膚年輕化的用途。 最近開(kāi)展新型冠狀病毒的生物信息學(xué)研究, 發(fā)現(xiàn)了中藥有效成分山奈酚具有抗新型冠狀病毒作用,其IC50~34。通過(guò)超算篩選出了一個(gè)新冠病毒的有效多肽抑制劑——人腸防御素5。該多肽抑制劑通過(guò)掩蔽受體, 人血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2(ACE2)抑制新冠病毒(SARS-CoV-2)突刺蛋白對(duì)人黏膜細(xì)胞的侵襲,從而阻斷新冠病毒傳染途徑,并與陸軍軍醫(yī)大學(xué)合作開(kāi)展實(shí)驗(yàn)室驗(yàn)證研究,論文發(fā)表在 Gastroenterology之上,被列為“Faculty Opinions”推薦論文,并由德國(guó)基爾大學(xué)的免疫學(xué)專(zhuān)家Jens-Michael Schr?der教授進(jìn)行點(diǎn)評(píng),評(píng)論指出了該項(xiàng)工作給預(yù)防或治療新冠肺炎提供全新途徑—既可以使用HD5作為治療藥物,也可以通過(guò)刺激內(nèi)源性HD5的合成來(lái)預(yù)防或治療。
邀請(qǐng)單位:生物與食品工程學(xué)院,化學(xué)與制藥工程學(xué)院,醫(yī)學(xué)院